疫情发生后，各级党委和政府对此高度重视，卫生部、安徽省卫生厅迅速派出专家组赴阜阳指导调查病因，全力救治患儿。安徽省疾控中心在国家专家协助下已经分离出肠道病毒71型病毒株；临床专家已经初步摸索出有针对性的治疗方案，发病患儿得到及时规范治疗，重症患者治愈率不断提高；当地的各项防控措施也得到全面落实。
据了解，为了进一步控制疫情，安徽省、阜阳市紧急划拨400万元人民币，专项用于防治工作，并在该市所有5岁以下儿童家庭发放《婴幼儿（特别是5岁以下）肠道传染病防治要点》，增加预防意识和防病能力。另外，大力整顿农村卫生环境、发放消毒液、清除生活垃圾。面向全省医疗机构和疾控机构专业人员的相关培训班也于4月28日在阜阳市举办。
卫生专家提醒广大群众，眼下是肠道病毒感染容易发生的季节，要积极做好环境、食品卫生和个人卫生，饭前便后洗手，保持室内空气流通；家长要尽量少带婴幼儿去拥挤的场所；学校和幼儿园要加强卫生管理，做好晨间体检；如果发现孩子发热、出疹等不适症状者，要及时送当地县级以上综合医院就医。
专家还对此给出了简明扼要的15字防控措施：洗净手、喝开水、吃熟食、勤通风、晒衣被。
